Pobierz 64-bitowy system Java. Organizacja bezpieczeństwa Java i aktualizacje. Korzyści z niezależnej od platformy implementacji Java

Slajdy referencyjne zawierające obrazy z pewną chiralnością zastosowano do potwierdzenia prawidłowej orientacji mikroskopu i interpretacji przesyłanej ścieżki za pomocą oprogramowania analitycznego. Wszystkie eksperymenty zakończono w ciągu 80 minut po zebraniu pasożytów, a próbki kontrolne analizowano zarówno na samym początku, jak i na końcu każdego eksperymentu, aby upewnić się, że warunki obrazu i pasożyta były stałe. Zastosowano algorytm autoregresyjnego śledzenia ruchu z maksymalną odległością 0 μm, aw razie potrzeby zastosowano maksymalny rozmiar przerwy podczas korelacji z translacją i rotacją dryfu, a niezbędne dane ręcznie sprawdzono po korekcji dryfu, aby upewnić się, że algorytm został odpowiednio wykonany.

Przetwarzanie i analiza błędów

Późniejsze przetwarzanie i analizę uzyskanych punktów kontrolnych dla każdego organizmu przeprowadzono za pomocą specjalnego pakietu oprogramowania specjalnie opracowanego do tego celu. Kluczową zasadą oprogramowania jest to, że użytkownik będzie w stanie graficznie i ilościowo sprawdzić każdy etap procesu.

Pasożyty o całkowitym ruchu trajektorii większym niż 2 μm uznano za ruchome na podstawie analizy preparatu przeciwgorączkowego; trajektorie te poddano wygładzeniu Fouriera i obliczeniu parametrów, jak omówiono poniżej. Pasożyty o całkowitym przemieszczeniu ścieżki 2 μm lub mniej uznano za stacjonarne i zostały wyłączone z dalszej analizy.

Krótka historia rozwoju technologii Java i jej aktualny status

Dość rzadka próbka czasowa położenia każdego organizmu w połączeniu z błędem pozycji w tych współrzędnych wymagała zastosowania pewnego rodzaju wygładzania i interpolacji do współrzędnych punktu trasy. Proste zmodyfikowane podejście Fouriera do każdego zestawu sygnałów dźwiękowych wszystkich organizmów wykonało najlepsze z kilku sprawdzonych podejść. Oceniliśmy te podejścia, stosując kryterium „parzystej” walidacji krzyżowej, w której w dopasowaniu zastosowano parzyste punkty toru, i ustalono krzyżowo niedopasowane resztkowe niedopasowanie między zaobserwowanymi a odpowiednimi współrzędnymi nieparzystych punktów toru.

Podobnie, nieparzyste punkty śladu zastosowano do dopasowania i dopasowania niedopasowania mierzonego z parzystymi punktami śladu. - Potwierdzoną rozbieżność obliczono jako pierwiastek kwadratowy z sumy tych dwóch kwadratów rozbieżności. Ta forma walidacji krzyżowej naśladuje efekt prędkości zbierania danych, która jest o połowę większa od prędkości rzeczywistej, i określa ilościowo, jak dobrze możemy przewidzieć „brakujące” dane w tym przypadku. Optymalną kolejność Fouriera, t, dla dopasowania dla każdej trajektorii ciała, określono za pomocą parzystej nieparzystej kontroli krzyżowej.

Stosowano techniki Fouriera, o ile istniała wystarczająca liczba punktów śladowych dla danej trajektorii. punkty kontrolne niekoniecznie korelowały z długością ścieżki, dlatego podzbiór ścieżek z poruszających się pasożytów został uznany za „nieodpowiedni” i został wykluczony z późniejszej analizy. Współrzędne wygładzonej trajektorii w danym czasie są obliczane przez oszacowanie szeregu Fouriera o współczynnikach podanych powyżej. Trajektoria uchwycona w regularnych odstępach długości łuku jest łatwo obliczana przez obliczeniowe całkowanie długości łuku w czasie.

Całkowita długość ścieżki dla danego organizmu jest zintegrowaną długością ścieżki wzdłuż wygładzonej ścieżki od pierwszego do ostatniego punktu śladu. Całkowity ruch to prosta odległość od pierwszego do ostatniego punktu kontrolnego dla ciała.

Dyskretne pomiary prędkości zostały obliczone jako prosta odległość między dwoma kolejnymi ścieżkami, wybranymi w regularnych odstępach długości ścieżki wzdłuż ścieżki wygładzonej Fouriera podzielonej przez przedział czasu między tymi punktami. Maksymalna prędkość odpowiada największej prędkości obserwowanej wzdłuż wygładzonej trajektorii Fouriera.

Istotność statystyczna między próbkami jest oznaczona gwiazdkami. Przedstawione wyniki reprezentują średnią ± odchylenie standardowe z czterech do pięciu niezależnych eksperymentów, z których każdy jest wykonywany w trzech powtórzeniach lub czterech instancjach. To pokazało, że standardowa analiza dwuwymiarowej ruchliwości nie może być całkowicie dokładnym odzwierciedleniem ruchliwości pasożyta w tkankach gospodarza. Staraliśmy się badać to zachowanie na większej liczbie pasożytów oraz w bardziej zdefiniowanym i kontrolowanym środowisku.

Ilościowa ocena parametrów trajektorii trójwymiarowych

Aby dalej scharakteryzować i określić ilościowo parametry tej formy mobilności, opracowaliśmy półautomatyczne metody śledzenia współrzędnych położenia pasożytów i przywracania ich trajektorii do szczegółowej analizy. Utworzono dwa rodzaje „stacjonarnych” zestawów pasożytów, aby ocenić całkowity błąd spowodowany ruchem Browna i błędem śledzenia z oprogramowania do analizy. Spośród kilku przetestowanych kryteriów ogólne przemieszczenie trajektorii przeprowadzono najlepiej z punktu widzenia różnicy między pasożytami poruszającymi się i nieruchomymi.

Kiedy trajektorie zostały wygładzone przez zastosowanie zmodyfikowanej korespondencji Fouriera, było oczywiste, że prędkość pasożyta wzdłuż trajektorii oscylowała między minimami i maksimami, odzwierciedlając gwałtowne prędkości, gdy pasożyty poruszały się przez Matrigel. Ponadto na trajektorii widoczna była złożona i okresowa zależność między prędkością, krzywizną i skrętem. Trajektorie zmniejszyły krzywiznę i skręcanie wraz z przyspieszeniem pasożytów, ale gdy tylko lokalna maksymalna prędkość została osiągnięta, stopniowe spowolnienie wiązało się ze stopniowym wzrostem krzywizny i skręcania.

Kiedy krzywizna i skręcenie osiągnęły maksimum, pasożyt albo powtórzył cykl, albo chwilowo zatrzymał się na zmienny okres czasu, na co wskazuje niska prędkość i gwałtownie fluktuacja krzywizny i skręcania. Zauważ, że wartości skrętu są ujemne, aby odzwierciedlić lewą naturę trajektorii, tak więc wzrost skrętu jest przedstawiany jako coraz bardziej ujemne wartości na wykresach.

Przeanalizowano tysiące trajektorii, a porównywalne odsetki pasożytów przesunęły się we wszystkich trzech liniach. Na przykład cyfrowa mikroskopia holograficzna została wykorzystana do scharakteryzowania zachowania pływającego dinoflagellatów, natomiast holograficzna wizualizacja na krysztale została przeprowadzona w celu analizy trajektorii plemników ludzi i koni. W badaniu łączącym aspekty biologii i geometrii różnicowej „trajektorię ostatniej spirali” zastosowano do trajektorii organizmów swobodnie pływających, aby można je było matematycznie wyrazić i porównać za pomocą elementów parametru Freneta-Serretta.

Akwizycja obrazu związana z oprogramowanie  do półautomatycznego śledzenia i analizy parametrów, w celu uzyskania systemu o średniej przepustowości, w którym ruchliwość setek tachyzoitów może być jednocześnie wyświetlana i analizowana. Zapewnia to ilościowy sposób ustalenia, które konkretne parametry trajektorii są zakłócane przez mutacje lub małe cząsteczki, które zmieniają ruchliwość pasożyta. Pokazujemy tutaj, że wszystkie tachyzoity poruszające się w małżowinie myszy lub w Matrigelu robią to wzdłuż trajektorii prętów.

Morfologia kilku mikroorganizmów jest najwyraźniej związana z możliwością przemieszczania się w odpowiednich niszach ekologicznych. Razem te obserwacje pokazują, że pasożyty apikompleksowe mogą mieć podstawę strukturalną dla swoich prętowych trajektorii w trójwymiarowym medium. Skala \u003d 50 μm. Histogram ruchów trajektorii dla żaroodpornego preparatu pasożytniczego. 6% pasożytów zabitych przez ciepło miało przesunięcie trajektorii o 2 μm lub mniej, a pozostałe trajektorie były spowodowane zniekształceniem artefaktów.

Przedstawione wyniki to dwa niezależne eksperymenty. Schematyczny opis krzywizny. Duże zagięcie krzywej w danym punkcie prowadzi do ciągłego okręgu o mniejszym promieniu, a zatem ma większą krzywiznę w tym punkcie. Schematyczny opis skręcania. W granicy chwilowe skręcenie krzywej w punkcie p jest określone przez wyrażenie m odwrotne do promienia tej kuli. Pasożyty poruszają się w korkociągu, często z przerwami między każdą jednostką ruchu. Odtwarzanie wideo jest ustawione na 31 ×.

Odtwarzanie wideo jest ustawione na 8 ×. Fluorescencyjne jądra pasożyta obrazowano w objętości 402 μm x 401 μm x 40 μm co 88 s przez 60 s za pomocą wideo mikroskopii fluorescencyjnej w dziedzinie czasu. Pasożyty poruszają się po lewych, prętowych trajektoriach w Matrigel; jedna reprezentatywna trajektoria jest podświetlona na zielono. Odtwarzanie wideo jest ustawione na częstotliwość 5 ×.

Finansiści nie odegrali żadnej roli w rozwoju badań, gromadzeniu i analizie danych, decyzji o publikacji lub przygotowaniu manuskryptu. Cyfrowa mikroskopia holograficzna wykrywa wywołane przez naturę zmiany w pływającym zachowaniu drapieżnych dinoflagellatów. Kudryashev M. Münter S. Lemgrauber L. Montagna G. Stahlberg H. i wsp. Strukturalne podstawy chiralności i orientacji ruchliwości sporozoitów plazmatycznych.